当寺は、文禄三年（一五九四）三月、将軍家関東御入国の際、下総矢喰村（現在の矢切） の杉浦・近藤家等が釋順誓師を三河国刈谷郡（現在の愛知県刈谷市）より招聘して、下総矢喰村に一宇を建立し、光明山西蓮寺と号したと記録されております。その後、一九年を経た慶長十八年（一六一三）十月、松戸の永井両家の招聘で現地に寺地を移転して、今日に至っております。その時期は、慶長五年（一六〇〇）の関ヶ原の戦い以後、徳川家康公の天下統一が完成された頃です。 尚、現在の本堂は第十世釋宗禎師により再建され、嘉永四年（一八五一）の建築で約一世紀半の星霜を経ております。 西蓮寺の歴代住職は教育熱心で、江戸時代末期に、本堂で寺子屋を開き近隣子弟の教育に当たっていたと伝えられています。そして、明治六年（一八七三）には、近隣でいち早く同寺を仮校舎として松戸小学校(現中部小)が創立されました。境内には、教え子たちの手で高等小学校第二代校長「小林鎮一郎先生」の碑（筆子塚）が建てられ、松戸の変遷を今も見守っています。